Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms