Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPUSD1Q9UJJ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms