Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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