Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00474Q9P2X8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00474Q9P2X8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00474Q9P2X8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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LINC00474Q9P2X8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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LINC00474Q9P2X8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00474Q9P2X8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00474Q9P2X8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LINC00474Q9P2X8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00474Q9P2X8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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