Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNPLA3Q9NST1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PNPLA3Q9NST1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms