Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.6 ms