Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM8AQ9HCN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM8AQ9HCN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms