Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGQ9H9S0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms