Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDT1Q9H211 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDT1Q9H211 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDT1Q9H211 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms