Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM3Q9BZL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms