Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms