Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNBD2Q96M20 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms