Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E2Q96LR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms