Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF6Q96J87 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms