Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX27Q96GQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms