Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE3Q969Y0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms