Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A1Q8WWI5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms