Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRCQ7RTU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCQ7RTU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms