Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP3Q6Q6R5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms