Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPO2Q5TGU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms