Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SHROOM2Q13796 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SHROOM2Q13796 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
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