Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SCGB2A2Q13296 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SCGB2A2Q13296 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SCGB2A2Q13296 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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