Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIRE1Q08AE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms