Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2IP78347 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms