Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms