Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCE1P61221 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCE1P61221 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms