Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB10P61026 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB10P61026 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB10P61026 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB10P61026 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB10P61026 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB10P61026 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB10P61026 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB10P61026 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB10P61026 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB10P61026 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB10P61026 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB10P61026 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB10P61026 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB10P61026 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB10P61026 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB10P61026 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms