Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSE1LP55060 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSE1LP55060 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms