Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18A1P54219 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A1P54219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms