Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO2P25791 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO2P25791 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO2P25791 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO2P25791 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO2P25791 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO2P25791 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO2P25791 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO2P25791 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO2P25791 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO2P25791 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO2P25791 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMO2P25791 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms