Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF28P17035 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF28P17035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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