Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms