Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2BP0DMW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2BP0DMW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms