Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APODP05090 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APODP05090 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APODP05090 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APODP05090 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APODP05090 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APODP05090 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APODP05090 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APODP05090 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APODP05090 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APODP05090 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APODP05090 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APODP05090 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APODP05090 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APODP05090 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APODP05090 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APODP05090 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APODP05090 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APODP05090 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APODP05090 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APODP05090 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms