Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED1O96006 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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