Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms