Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIN3BO75182 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3BO75182 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms