Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP1O75113 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP1O75113 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms