Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB2O43679 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB2O43679 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB2O43679 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB2O43679 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB2O43679 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB2O43679 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB2O43679 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB2O43679 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB2O43679 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB2O43679 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB2O43679 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB2O43679 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms