Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCP110O43303 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCP110O43303 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCP110O43303 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCP110O43303 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCP110O43303 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCP110O43303 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCP110O43303 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCP110O43303 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCP110O43303 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.1 ms