Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC11O43248 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC11O43248 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms