Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8CPA6NN73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms