Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L9A6NEM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L9A6NEM1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L9A6NEM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms