Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 FBXO11-207ENST00000470899 908 ntTSL 34.34□□□□□ -1.712e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.53□□□□□ -22e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 21.96□□□□□ -2.12e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.22e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 LCAT-208ENST00000575467 842 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 LCAT-206ENST00000573846 568 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 LCAT-207ENST00000575277 573 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 LCAT-209ENST00000576450 359 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-12■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-19■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-19■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PAH-208ENST00000549247 961 ntTSL 25.6□□□□□ -1.512e-19■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PAH-211ENST00000551114 1109 ntTSL 25.1□□□□□ -1.592e-19■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PAH-216ENST00000635477 429 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-19■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PPP1R10-206ENST00000484449 605 ntTSL 54.73□□□□□ -1.652e-15■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 PPP1R10-204ENST00000473954 470 ntTSL 33.81□□□□□ -1.82e-15■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-214ENST00000569320 641 ntTSL 311.37□□□□□ -0.594e-15■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-213ENST00000568453 571 ntTSL 49.6□□□□□ -0.874e-15■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-215ENST00000570201 292 ntTSL 33.75□□□□□ -1.814e-15■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-202ENST00000499044 2491 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 RNPS1-206ENST00000562205 2223 ntTSL 217.11■□□□□ 0.331e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-204ENST00000505068 3561 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 RNPS1-213ENST00000565243 3337 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-207ENST00000514161 1765 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-206ENST00000508091 419 ntTSL 39.43□□□□□ -0.91e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-203ENST00000502323 1794 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 GRSF1-205ENST00000506453 925 ntTSL 36.74□□□□□ -1.331e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 SNX5-207ENST00000474883 695 ntTSL 54.63□□□□□ -1.671e-8■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.851e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.491e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.081e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.571e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 CTSA-211ENST00000606066 603 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 CTSA-216ENST00000607212 590 ntTSL 412.53□□□□□ -0.42e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 CTSA-218ENST00000607814 584 ntTSL 412.22□□□□□ -0.452e-9■□□□□ 8.3
SF3A3Q12874 SLC38A10-210ENST00000573058 1627 nt24.92■■□□□ 1.583e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 321.71■■□□□ 1.073e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 LRRC45-206ENST00000583383 840 ntTSL 321.71■■□□□ 1.077e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.043e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 219.47■□□□□ 0.711e-16■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 ELL2-203ENST00000506628 520 ntTSL 518.86■□□□□ 0.617e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.02■□□□□ 0.477e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 317.78■□□□□ 0.447e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 PPT2-EGFL8-201ENST00000421600 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.58■□□□□ 0.43e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 EGFL8-221ENST00000432129 825 ntTSL 517.56■□□□□ 0.43e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 PPT2-EGFL8-203ENST00000428388 2878 ntAPPRIS P5 TSL 217.5■□□□□ 0.393e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 216.9■□□□□ 0.31e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 PPT2-EGFL8-206ENST00000583227 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.4■□□□□ 0.223e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 EGFL8-223ENST00000482938 533 ntTSL 316.35■□□□□ 0.213e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 EGFL8-222ENST00000466239 2441 ntTSL 216.19■□□□□ 0.183e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.147e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 515.52■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 LRRC45-202ENST00000577638 730 ntTSL 215.22■□□□□ 0.037e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 215.18■□□□□ 0.023e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-213ENST00000487660 610 ntTSL 215.08■□□□□ 07e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 514.97□□□□□ -0.017e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.043e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-218ENST00000487281 757 ntTSL 314.09□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-202ENST00000341154 2839 ntTSL 213.56□□□□□ -0.247e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.247e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 413.47□□□□□ -0.253e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 513.17□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-207ENST00000471724 443 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 RBM6-206ENST00000433811 582 ntTSL 313.07□□□□□ -0.323e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 212.95□□□□□ -0.347e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 512.86□□□□□ -0.357e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 212.85□□□□□ -0.353e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.381e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.381e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 JTB-205ENST00000461365 542 ntTSL 512.53□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 512.51□□□□□ -0.417e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SPG7-209ENST00000564047 422 ntTSL 212.33□□□□□ -0.447e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-212ENST00000485292 790 ntTSL 212.16□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 8.2
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