RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573058.1

SLC38A10-210, Transcript of solute carrier family 38 member 10, humanhuman

Gene SLC38A10, Length 1,627 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A10-210ENST00000573058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.67■■■■■ 6.82
SLC38A10-210ENST00000573058 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.54■■■■■ 5.68
SLC38A10-210ENST00000573058 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
SLC38A10-210ENST00000573058 ABCC9O60706 1549 aa47.85■■■■■ 5.25
SLC38A10-210ENST00000573058 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.77■■■■■ 5.24
SLC38A10-210ENST00000573058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.73■■■■■ 5.23
SLC38A10-210ENST00000573058 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.33■■■■■ 5.17
SLC38A10-210ENST00000573058 NACADO15069 1562 aa47.12■■■■■ 5.13
SLC38A10-210ENST00000573058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.79■■■■■ 5.08
SLC38A10-210ENST00000573058 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.77■■■■■ 5.08
SLC38A10-210ENST00000573058 SCRIBQ14160 1630 aa46.31■■■■■ 5
SLC38A10-210ENST00000573058 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.66■■■■■ 4.9
SLC38A10-210ENST00000573058 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.16■■■■■ 4.82
SLC38A10-210ENST00000573058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.8
SLC38A10-210ENST00000573058 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
SLC38A10-210ENST00000573058 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.7■■■■■ 4.75
SLC38A10-210ENST00000573058 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
SLC38A10-210ENST00000573058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
SLC38A10-210ENST00000573058 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.46■■■■■ 4.71
SLC38A10-210ENST00000573058 SMARCA4P51532 1647 aa44.4■■■■■ 4.7
SLC38A10-210ENST00000573058 WIZO95785 1651 aa44.11■■■■■ 4.65
SLC38A10-210ENST00000573058 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
SLC38A10-210ENST00000573058 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.88■■■■■ 4.62
SLC38A10-210ENST00000573058 SMARCA2P51531 1590 aa43.81■■■■■ 4.6
SLC38A10-210ENST00000573058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
SLC38A10-210ENST00000573058 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.7■■■■■ 4.59
SLC38A10-210ENST00000573058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
SLC38A10-210ENST00000573058 NCAPD3P42695 1498 aa43.41■■■■■ 4.54
SLC38A10-210ENST00000573058 HMGXB3Q12766 1538 aa43.39■■■■■ 4.54
SLC38A10-210ENST00000573058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.33■■■■■ 4.53
SLC38A10-210ENST00000573058 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.21■■■■■ 4.51
SLC38A10-210ENST00000573058 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.85■■■■■ 4.45
SLC38A10-210ENST00000573058 TRIM41Q8WV44 630 aa42.38■■■■■ 4.38
SLC38A10-210ENST00000573058 CFTRP13569 1480 aa42.36■■■■■ 4.37
SLC38A10-210ENST00000573058 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.29■■■■■ 4.36
SLC38A10-210ENST00000573058 PRDM2Q13029 1718 aa42.25■■■■■ 4.35
SLC38A10-210ENST00000573058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC38A10-210ENST00000573058 ABCC8Q09428 1581 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC38A10-210ENST00000573058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.33
SLC38A10-210ENST00000573058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.05■■■■■ 4.32
SLC38A10-210ENST00000573058 NESP48681 1621 aa41.85■■■■■ 4.29
SLC38A10-210ENST00000573058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.83■■■■■ 4.29
SLC38A10-210ENST00000573058 SYNJ1O43426 1573 aa41.81■■■■■ 4.28
SLC38A10-210ENST00000573058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
SLC38A10-210ENST00000573058 TOP2BQ02880 1626 aa41.75■■■■■ 4.27
SLC38A10-210ENST00000573058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.72■■■■■ 4.27
SLC38A10-210ENST00000573058 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.64■■■■■ 4.26
SLC38A10-210ENST00000573058 CUX1P39880 1505 aa41.62■■■■■ 4.25
SLC38A10-210ENST00000573058 EEA1Q15075 1411 aa41.48■■■■■ 4.23
SLC38A10-210ENST00000573058 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SLC38A10-210ENST00000573058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.44■■■■■ 4.23
SLC38A10-210ENST00000573058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.44■■■■■ 4.22
SLC38A10-210ENST00000573058 SOGA1O94964 1423 aa41.34■■■■■ 4.21
SLC38A10-210ENST00000573058 TOPBP1Q92547 1522 aa41.33■■■■■ 4.21
SLC38A10-210ENST00000573058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.26■■■■■ 4.2
SLC38A10-210ENST00000573058 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
SLC38A10-210ENST00000573058 ERCC6Q03468 1493 aa41.21■■■■■ 4.19
SLC38A10-210ENST00000573058 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.19■■■■■ 4.18
SLC38A10-210ENST00000573058 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.14■■■■■ 4.18
SLC38A10-210ENST00000573058 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.12■■■■■ 4.17
SLC38A10-210ENST00000573058 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.11■■■■■ 4.17
SLC38A10-210ENST00000573058 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
SLC38A10-210ENST00000573058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
SLC38A10-210ENST00000573058 CUX2O14529 1486 aa40.98■■■■■ 4.15
SLC38A10-210ENST00000573058 WDR62O43379 1518 aa40.94■■■■■ 4.14
SLC38A10-210ENST00000573058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
SLC38A10-210ENST00000573058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.88■■■■■ 4.14
SLC38A10-210ENST00000573058 KIF21BO75037 1637 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC38A10-210ENST00000573058 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.84■■■■■ 4.13
SLC38A10-210ENST00000573058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
SLC38A10-210ENST00000573058 GOLGA3Q08378 1498 aa40.82■■■■■ 4.13
SLC38A10-210ENST00000573058 WDR97A6NE52 1622 aa40.77■■■■■ 4.12
SLC38A10-210ENST00000573058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
SLC38A10-210ENST00000573058 IFT140Q96RY7 1462 aa40.67■■■■■ 4.1
SLC38A10-210ENST00000573058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.65■■■■■ 4.1
SLC38A10-210ENST00000573058 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
SLC38A10-210ENST00000573058 PRXQ9BXM0 1461 aa40.64■■■■■ 4.1
SLC38A10-210ENST00000573058 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC38A10-210ENST00000573058 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.6■■■■■ 4.09
SLC38A10-210ENST00000573058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC38A10-210ENST00000573058 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.55■■■■■ 4.08
SLC38A10-210ENST00000573058 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC38A10-210ENST00000573058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
SLC38A10-210ENST00000573058 CUL7Q14999 1698 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC38A10-210ENST00000573058 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC38A10-210ENST00000573058 PBRM1Q86U86 1689 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC38A10-210ENST00000573058 CEP162Q5TB80 1403 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC38A10-210ENST00000573058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.045e-6■■■□□ 16.9
SLC38A10-210ENST00000573058 GRIN2BQ13224 1484 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC38A10-210ENST00000573058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
SLC38A10-210ENST00000573058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC38A10-210ENST00000573058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC38A10-210ENST00000573058 CLIP1P30622 1438 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC38A10-210ENST00000573058 ADAMTS12P58397 1594 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC38A10-210ENST00000573058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
SLC38A10-210ENST00000573058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.01■■■■■ 4
SLC38A10-210ENST00000573058 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.98■■■■□ 3.99
SLC38A10-210ENST00000573058 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SLC38A10-210ENST00000573058 SYNJ2O15056 1496 aa39.83■■■■□ 3.97
SLC38A10-210ENST00000573058 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms