Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQE9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQE9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQE9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQE9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms