Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX13Q9Y5W8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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