Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB15Q9Y5E8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB15Q9Y5E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB15Q9Y5E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB15Q9Y5E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms