Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOP58Q9Y2X3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms