Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A1Q9Y2Q0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms